Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W7

Agr3, Anterior gradient protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agr3Q8R3W7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agr3Q8R3W7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agr3Q8R3W7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agr3Q8R3W7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agr3Q8R3W7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agr3Q8R3W7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agr3Q8R3W7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agr3Q8R3W7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agr3Q8R3W7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agr3Q8R3W7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agr3Q8R3W7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agr3Q8R3W7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agr3Q8R3W7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agr3Q8R3W7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agr3Q8R3W7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms