Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxn4Q8K3Q3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn4Q8K3Q3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms