Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3H0

Appl1, DCC-interacting protein 13-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Appl1Q8K3H0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Appl1Q8K3H0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Appl1Q8K3H0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms