Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim68Q8K243 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim68Q8K243 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim68Q8K243 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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