Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek9Q8K1R7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nek9Q8K1R7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek9Q8K1R7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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