Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CopaQ8CIE6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CopaQ8CIE6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms