Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIB5

Fermt2, Fermitin family homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt2Q8CIB5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fermt2Q8CIB5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fermt2Q8CIB5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fermt2Q8CIB5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fermt2Q8CIB5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fermt2Q8CIB5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fermt2Q8CIB5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fermt2Q8CIB5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fermt2Q8CIB5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms