Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ercc8Q8CFD5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ercc8Q8CFD5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ercc8Q8CFD5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc8Q8CFD5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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