Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9955Q8CEJ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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