Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc17Q8CE13 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc17Q8CE13 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms