Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc178Q8CDV0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms