Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A430089I19RikQ8C9W1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A430089I19RikQ8C9W1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A430089I19RikQ8C9W1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A430089I19RikQ8C9W1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A430089I19RikQ8C9W1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A430089I19RikQ8C9W1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A430089I19RikQ8C9W1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430089I19RikQ8C9W1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms