Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Camsap2Q8C1B1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Camsap2Q8C1B1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Camsap2Q8C1B1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Camsap2Q8C1B1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Camsap2Q8C1B1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Camsap2Q8C1B1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Camsap2Q8C1B1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Camsap2Q8C1B1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Camsap2Q8C1B1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Camsap2Q8C1B1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Camsap2Q8C1B1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms