Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X2

Slc9b1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9b1Q8C0X2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc9b1Q8C0X2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc9b1Q8C0X2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9b1Q8C0X2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9b1Q8C0X2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms