Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp38Q8BW70 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp38Q8BW70 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp38Q8BW70 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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