Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx17Q8BVL3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx17Q8BVL3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx17Q8BVL3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
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