Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad3Q8BUN5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad3Q8BUN5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad3Q8BUN5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad3Q8BUN5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad3Q8BUN5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad3Q8BUN5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad3Q8BUN5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad3Q8BUN5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad3Q8BUN5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad3Q8BUN5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad3Q8BUN5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms