Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rccd1Q8BTU7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rccd1Q8BTU7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rccd1Q8BTU7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms