Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp9Q8BTS3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp9Q8BTS3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp9Q8BTS3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp9Q8BTS3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms