Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gga3Q8BMI3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gga3Q8BMI3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gga3Q8BMI3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms