Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smoc1Q8BLY1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smoc1Q8BLY1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smoc1Q8BLY1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smoc1Q8BLY1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smoc1Q8BLY1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smoc1Q8BLY1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smoc1Q8BLY1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smoc1Q8BLY1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smoc1Q8BLY1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smoc1Q8BLY1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smoc1Q8BLY1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smoc1Q8BLY1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms