Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarcal1Q8BJL0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcal1Q8BJL0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.2 ms