Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd4aQ8BIE6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd4aQ8BIE6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd4aQ8BIE6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd4aQ8BIE6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd4aQ8BIE6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd4aQ8BIE6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd4aQ8BIE6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd4aQ8BIE6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms