Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp4f39Q8BGU0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms