Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubash3bQ8BGG7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ubash3bQ8BGG7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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