Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms