Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnb1Q8BG40 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Katnb1Q8BG40 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms