Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M10.6Q85ZW5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.7 ms