Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbed4Q80WQ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed4Q80WQ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed4Q80WQ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbed4Q80WQ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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