Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmcc2Q80W04 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc2Q80W04 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmcc2Q80W04 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms