Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Cdc42bpbQ7TT50 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Cdc42bpbQ7TT50 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Cdc42bpbQ7TT50 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cdc42bpbQ7TT50 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33,45■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33,4■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33,39■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Cdc42bpbQ7TT50 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33,36■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cdc42bpbQ7TT50 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33,27■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33,27■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,26■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Cdc42bpbQ7TT50 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Cdc42bpbQ7TT50 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33,14■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,2 ms