Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stk40Q7TNL3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stk40Q7TNL3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stk40Q7TNL3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk40Q7TNL3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stk40Q7TNL3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stk40Q7TNL3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stk40Q7TNL3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Stk40Q7TNL3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stk40Q7TNL3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stk40Q7TNL3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stk40Q7TNL3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms