Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox11Q7M6Y2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox11Q7M6Y2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms