Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpv1Q704Y3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpv1Q704Y3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trpv1Q704Y3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpv1Q704Y3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms