Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
March6Q6ZQ89 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
March6Q6ZQ89 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms