Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr12Q6QNU9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr12Q6QNU9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr12Q6QNU9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms