Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmeff1Q6PFE7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmeff1Q6PFE7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms