Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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