Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtifQ6PEE2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtifQ6PEE2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtifQ6PEE2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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