Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mfsd4aQ6PDC8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mfsd4aQ6PDC8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd4aQ6PDC8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms