Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frem2Q6NVD0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frem2Q6NVD0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms