Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KdsrQ6GV12 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KdsrQ6GV12 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms