Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf8Q6DID3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf8Q6DID3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf8Q6DID3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Scaf8Q6DID3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms