Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Fgd6Q69ZL1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Fgd6Q69ZL1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Fgd6Q69ZL1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Fgd6Q69ZL1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Fgd6Q69ZL1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fgd6Q69ZL1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fgd6Q69ZL1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Fgd6Q69ZL1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fgd6Q69ZL1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fgd6Q69ZL1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fgd6Q69ZL1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Fgd6Q69ZL1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Fgd6Q69ZL1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Fgd6Q69ZL1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Fgd6Q69ZL1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Fgd6Q69ZL1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Fgd6Q69ZL1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Fgd6Q69ZL1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fgd6Q69ZL1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Fgd6Q69ZL1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Fgd6Q69ZL1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fgd6Q69ZL1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fgd6Q69ZL1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Fgd6Q69ZL1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fgd6Q69ZL1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Fgd6Q69ZL1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fgd6Q69ZL1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Fgd6Q69ZL1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms