Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msl2Q69ZF8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms