Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp4Q68FH0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkp4Q68FH0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms