Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Git1Q68FF6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Git1Q68FF6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Git1Q68FF6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Git1Q68FF6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms