Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Ift52Q62559 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ift52Q62559 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift52Q62559 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms