Protein–RNA interactions for Protein: Q62398

Cnga2, Cyclic nucleotide-gated olfactory channel, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga2Q62398 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnga2Q62398 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnga2Q62398 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga2Q62398 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga2Q62398 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 753.8 ms