Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SypQ62277 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SypQ62277 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SypQ62277 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SypQ62277 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SypQ62277 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SypQ62277 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SypQ62277 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SypQ62277 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SypQ62277 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SypQ62277 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SypQ62277 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SypQ62277 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SypQ62277 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SypQ62277 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SypQ62277 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SypQ62277 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SypQ62277 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SypQ62277 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SypQ62277 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SypQ62277 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SypQ62277 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SypQ62277 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SypQ62277 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SypQ62277 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SypQ62277 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SypQ62277 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SypQ62277 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SypQ62277 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SypQ62277 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SypQ62277 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SypQ62277 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SypQ62277 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SypQ62277 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SypQ62277 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SypQ62277 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SypQ62277 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SypQ62277 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SypQ62277 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SypQ62277 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SypQ62277 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SypQ62277 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SypQ62277 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SypQ62277 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SypQ62277 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SypQ62277 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SypQ62277 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SypQ62277 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SypQ62277 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SypQ62277 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SypQ62277 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SypQ62277 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SypQ62277 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SypQ62277 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SypQ62277 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SypQ62277 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SypQ62277 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SypQ62277 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SypQ62277 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SypQ62277 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SypQ62277 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SypQ62277 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SypQ62277 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SypQ62277 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SypQ62277 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SypQ62277 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SypQ62277 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SypQ62277 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SypQ62277 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SypQ62277 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SypQ62277 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SypQ62277 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SypQ62277 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SypQ62277 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SypQ62277 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SypQ62277 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SypQ62277 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SypQ62277 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SypQ62277 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SypQ62277 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SypQ62277 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SypQ62277 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SypQ62277 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SypQ62277 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SypQ62277 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SypQ62277 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SypQ62277 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SypQ62277 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SypQ62277 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SypQ62277 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SypQ62277 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SypQ62277 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SypQ62277 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SypQ62277 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SypQ62277 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SypQ62277 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SypQ62277 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SypQ62277 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SypQ62277 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SypQ62277 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms