Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six2Q62232 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six2Q62232 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Six2Q62232 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six2Q62232 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Six2Q62232 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Six2Q62232 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Six2Q62232 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Six2Q62232 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six2Q62232 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six2Q62232 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Six2Q62232 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms